Racine liégeuse et dépérissement des plants de tomate en Ontario

Renseignements généraux

En 2009, beaucoup de champs de tomate de transformation ont connu une croissance limitée ou un dépérissement prématuré du feuillage. Dans de nombreux cas, cela a eu de graves effets sur le rendement et la qualité. On constate des problèmes semblables dans certains champs depuis des années, mais les tentatives pour déterminer la cause ou trouver un moyen de gérer le problème ont échoué.

Le ministère de l'Agriculture, de l'Alimentation et des Affaires rurales, en collaboration avec Tomecek Agronomy Services et avec l'aide de cultivateurs, de transformateurs, de conseillers et de chercheurs, a effectué un échantillonnage d'envergure dans les champs de la zone de culture de la tomate de transformation en 2009. Les échantillons de racine ont été remis à Jim Traquair, d'Agriculture et Agroalimentaire Canada (London), pour qu'il les analyse.

M. Traquair a examiné les symptômes et a pu cultiver et identifier le pathogène Pyrenochaeta lycopersici, l'organisme qui cause la maladie de la racine liégeuse, dans les tissus provenant de nombreux champs qui présentaient les symptômes. Cette maladie peut réduire considérablement le rendement et la qualité de la tomate, particulièrement par temps frais. Des facteurs de stress additionnels ont été relevés dans ces champs, notamment d'autres pathogènes du sol, des pathogènes foliaires ou des concentrations élevées de nématodes. Pour beaucoup de champs, l'examen du système racinaire a révélé qu'il subissait également une restriction physique causée par le tassement du sol.
Il semble que nous ayons affaire à un ensemble de facteurs de stress, y compris des pathogènes et un milieu de culture défavorable, qui nuisent à la croissance et entraînent la perte prématurée de feuillage dans de nombreux champs de tomate de l'Ontario. Des recherches visant à déterminer plus précisément les causes et les moyens de gérer ce problème lié à la tomate de plein champ de l'Ontario sont en cours.

Qu'est-ce que la racine liégeuse?

Symptômes

(voir les photos)

Au-dessus du sol, du début au milieu de la saison :

• plants rabougris à croissance lente (dans certains champs);
• présence fréquente de taches.

Au-dessus du sol, nouaison/développement du fruit :

• jaunissement du feuillage, souvent en taches;
• dépérissement à partir du bout des feuilles et des branches;
• dans les cas avancés, mort de la plupart du feuillage bien avant la date de récolte prévue et réduction de la qualité du fruit.

Figure 1: Dépérissement prématuré du feuillage.

Figure 2: Dépérissement prématuré du feuillage.

Dans le sol :

• beaucoup de racines adventives au collet;
• perte de petites racines;
• lésions brunes lisses, bandes brunes autour des racines, bris, enflure;
• le tissu externe de la racine pourrit et se détache, le faisceau libéro-ligneux (coeur) de la racine est intact;
• pourriture étendue de tout le système racinaire.

Figure 3: Racines présentant des symptômes.

Figure 4: Racines présentant des symptômes.

Figure 5: Racines saines (pour comparaison).

Figure 6: Racines saines (pour comparaison).

Comme la maladie affaiblit le système racinaire, le premier signe du problème au-dessus du sol peut être l'apparition soudaine de symptômes foliaires à l'arrivée du temps chaud et sec. Dans d'autres cas, la croissance ralentie des plants est évidente au début de la saison.

Biologie

On trouve la racine liégeuse chez la tomate de plein champ dans de nombreuses régions du monde, y compris la Californie. Les cultures hôtes comprennent la tomate, le poivron, l'aubergine, le concombre, le melon et la courge. On signale que la betterave peut aussi être un hôte asymptomatique. Certaines herbes de la famille des solanacées peuvent aussi être des hôtes.

Le pathogène peut persister dans le sol pendant plusieurs années sous la forme de microsclérotes et on le trouve loin sous la surface. Puisque le champignon croît très lentement, la maladie s'étend lentement avec le temps. Le pathogène ne se répand pas par voie aérienne, mais par le sol ou les débris de racine infectés.

Le temps frais favorise la racine liégeuse : son développement est optimal entre 15 et 20 °C (59 et 68 °F). Les plants repiqués dans un sol frais sont les plus vulnérables. Les symptômes ont pu être plus graves en 2009 en raison de la fraîcheur de la saison de croissance, de la fraîcheur des sols et, dans de nombreux champs, de la croissance racinaire restreinte par un sol tassé.

Les infections qui surviennent tôt causent le plus de dommages, mais les symptômes peuvent rester invisibles jusqu'à deux ou trois mois plus tard.

Gestion

Il est difficile de lutter contre ce pathogène. Selon l'expérience d'autres territoires, la fumigation donne des résultats variables même jusqu'à 12 po de profondeur. Comme le champignon peut se trouver loin sous la surface, les racines qui croissent au-delà de la couche fumigée peuvent rencontrer le pathogène. La rotation des cultures peut ralentir l'accumulation du pathogène, mais n'est probablement pas efficace pour réduire les niveaux dans les champs infectés. Si d'autres facteurs contribuent au problème, il faut les gérer également. Les fongicides n'ont aucun effet sur la maladie.

Résumé

Vraisemblablement, ce pathogène est présent dans nos sols depuis longtemps et fait partie d'un ensemble de pathogènes racinaires et foliaires en interaction avec d'autres facteurs de stress. On voit des symptômes semblables depuis de nombreuses années, mais la racine liégeuse n'a pas été détectée, probablement parce qu'elle n'est pas facilement cultivable au moyen des milieux de culture habituels. Les symptômes étaient très répandus dans les champs et dans les zones de culture d'Essex et de Kent en 2009. Puisque le pathogène croît très lentement, les caractéristiques de l'incidence ne suggèrent pas une introduction récente.

L'expérience californienne suggère que la maladie ne se déclare pas dans tous les champs infectés chaque année, mais qu'elle s'aggravera avec le temps.
Il n'y a probablement pas de solution simple à ce problème, mais les cultivateurs devraient éliminer les facteurs de stress qu'ils peuvent contrôler dans les champs (p. ex., maladie foliaire, tassement du sol, rotation des cultures, humidité).